The generation of small RNAs; who needs Dicer? @ 17-11-2008 22:11
Up until 2006 it was believed that most, if not all, small RNAs in RNA silencing were synthesized via members of the Dicer-like RNase III endonuclease family. In animals, small interfering RNAs (siRNAs) are cleaved from long double-stranded RNA by Dicer enzymes, and microRNAs (miRNAs) are released from genome-encoded stem-loop precursors through the sequential action [...]
Özürün nedeni Tiktaalik rosea mı? @ 02-10-2008 21:22
Anglo-Glikan kilisesi geçtiğimiz Eylül ayında evrim teorisinin babası Charles Darwin’den özür dilemişti. Bunun nedeni Darwin’in 2. kuşak torununun belirttiği gibi “kendini iyi hissetmek” için miydi? Yoksa 2009’un İngilterede “Darwin Yılı” ilan edilip teorinin 200. yıldönümünün kutlanacak olması mı? Ya da 2004’de sudan karaya geçişi kanıtlayan geçiş formu Tiktaalik rosea ‘nin bulunması mı? Bir başka olasılıksa [...]
RNA düzenlenmesi: yeni genetik mi?(1) @ 17-09-2008 13:33
Kodlanan ve kodlanmayan protein genlerinin intron ve ekzonlarından kaynaklanan RNA’lar yüksek organizmaların genetik işletim sisteminin gelişmesinde rol oynadı mı? Genomik ve karşılaştırmalı moleküler genetikden elde edilen bulgular durumun bu olabileceğini göstermektedir. Moleküler biyolojide belki de en temel inanış genlerden proteinlerin kodlanmasını anlatan sentral dogmadır. Sentral dogma, genetik bilginin DNA’dan RNA’ya ve proteinlere doğru aktığını söyler. [...]
Obesity gene @ 08-07-2008 11:26
Obesity is a major public health problem with strong genetic determination; however, the genetic factors underlying obesity are largely unknown. In this study, we performed a genome-wide association scan for obesity by examining approximately 500 000 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in a sample of 1000 unrelated US Caucasians. We identified a novel gene, CTNNBL1, which has [...]
Perfect DNA molecules from imperfect oligonucleotides @ 18-06-2008 21:29
Making faultless complex objects from potentially faulty building blocks is a fundamental challenge in computer engineering, nanotechnology and synthetic biology. Here, we show for the first time how recursion can be used to address this challenge and demonstrate a recursive procedure that constructs error-free DNA molecules and their libraries from error-prone oligonucleotides. Divide and Conquer [...]
The Invasion @ 13-06-2008 14:13
Invasion (Istila) ve Nicole Kidman ismini birlikte görünce biraz yadırgadım. Kidman daha önce bilim-kurgu filmlerde pek görülmedi. Alman yönetmen Oliver Hirschbiegel’in eli değince “Invasion” klasik holywood tarzinin biraz dışına çıkmış. Gayet görülesi, keyifli sonlara doğru gerilimli bir sinema örneği olmuş. Bu konu daha öncede işlenmişti. Virüsler yayılır. İnsanlar çıldırır yada bir çeşit yamyamvari görüntüler ortaya [...]
Bakteri hücreleri arasında haberleşme (Cell-to-cell communication: quorum sensing) @ 12-05-2008 16:26
Yakın zamana kadar tek ve çok hücreli organizmaları ayırmada önemli bir fark çok hücrelilerde hücrelerarası iletişimin olmasıydı. Yüksek canlılarda hücreler arasında sinyallerin gelip gitmesi, karmaşık sinyal yollarının olması onları tek hücrelilerden ayıran bir özellikti. Şimdi ise aynı türden yada farklı türlerden bakterilerin kendi aralarında haberleşebildiğini biliyoruz. Üstelik bu özellik bakterilerin yaşamsal fonksiyonlarıyla yakından ilişkili. Bir [...]
Gelecek İçin Tahminler @ 07-05-2008 12:51
Uzun süredir bloğuma yazamıyordum. Ama bu bloğu takip ederek olumlu ve motive edici yorumlarını gönderen arkadaşlar sağolsunlar bu sorumluluğumu bir kez daha hatırlattılar, tekrar bir şeyler yazma ve paylaşma isteği doğdu. Herkes günlük sorunlarla uğraşırken, yoğun çalışma temposu içinde zaman zaman kaybolurken bilim adamları dur durak bilmeden yeni bilgi ve teknolojileri geliştirmekle meşguller. Sanırım artık [...]
Detailed gene map ‘within grasp’ @ 23-01-2008 11:35
One thousand people are to have their genomes mapped in a major effort to understand how genes influence disease.To date, only a handful of humans have had their genes analysed in this way, including scientists Craig Venter and James Watson, and anonymous volunteers. Teams in the UK, US and China say the project will create the [...]
Synthetic DNA on the Brink of Yielding New Life Forms @ 18-12-2007 21:28
It has been 50 years since scientists first created DNA in a test tube, stitching ordinary chemical ingredients together to make life’s most extraordinary molecule. Until recently, however, even the most sophisticated laboratories could make only small snippets of DNA — an extra gene or two to be inserted into corn plants, for example, to [...]
